L’organisme Les Amis des IRSC est géré par un conseil d’administration de 16 personnes élues par les membres réunis lors d’une assemblée générale annuelle organisée chaque automne dans une grande ville canadienne. Les membres du conseil se voient confier un mandat de trois ans au terme duquel ils peuvent se re-présenter aux élections autant de fois qu’ils le souhaitent. Les membres siègent au conseil à titre gratuit.

Le conseil d’administration se réunit deux fois par an au moyen de conférences téléphoniques. Un conseil exécutif de quatre personnes, comprenant un président, un vice-président, un secrétaire et un trésorier, se réunit autant de fois qu’il le faut pour assurer la bonne marche de l’organisme. Des comités spéciaux et des comités permanents sont parfois constitués, lorsque nécessaire. Actuellement, un comité consultatif participe à la gestion du Prix international de la recherche en santé Henry G. Friesen.

Le conseil d’administration représente des adhérents qui œuvrent dans des universités, des hôpitaux, des organismes bénévoles, des groupes et organismes communautaires et des sociétés privées à travers le pays.